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秋風(fēng)送爽,丹桂飄香。緊張的疫情形勢隨夏暑漸漸遠去,2021年新一代測序技術(shù)培訓(xùn)班暨全國NGS建庫及創(chuàng)新大賽再度踏風(fēng)而來,于2021年9月24-25日對醫(yī)療機構(gòu)實驗室操作人員進行理論培訓(xùn),9月26日-29日進行實操培訓(xùn)。
迄今為止,中國遺傳學(xué)會遺傳診斷分會、上海市臨床檢驗中心、上海市遺傳學(xué)會已經(jīng)成功地聯(lián)合舉辦了三屆全國NGS建庫技能大賽。大賽為NGS技術(shù)在臨床應(yīng)用以及推動診斷技術(shù)創(chuàng)新升級提供了良好的交流平臺,厚澤生物作為三屆大賽的質(zhì)控設(shè)備獨家贊助商,有幸獲得參會老師們的高度認可。而今,厚澤生物再次作為第四屆大會理論及實操贊助商與大家見面,共赴秋季之約。
會議信息
活動地點
理論培訓(xùn):上海青松城大酒店4樓勁松廳
實操培訓(xùn):楊浦區(qū)城投寬庭灣谷社區(qū)科技園
序列是基因組學(xué)最基本最重要的數(shù)據(jù),也是生命科學(xué)領(lǐng)域大數(shù)據(jù)時代的核心組成部分。高通量測序(next-generation sequencing,NGS)具有通量高、信息量大等特點,是現(xiàn)今“精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)”發(fā)展的基礎(chǔ),應(yīng)用范圍涉及病原微生物檢測、腫瘤個體化診療/早期篩查、產(chǎn)前無創(chuàng)檢測(Noninvasive Prenatal Testing,NIPT)/胚胎種植前基因診斷(Pre-implantationGenetic Diagnosis,PGD)等多個領(lǐng)域。
由于高通量測序儀無法識別天然的DNA分子,所以在測序前需要在天然分子的兩端加上測序儀可以識別的通用序列,這個過程稱為文庫構(gòu)建;待上機測序的DNA分子稱為文庫分子。NGS檢測性能主要取決于建庫技術(shù)。文庫構(gòu)建,尤其是DNA文庫構(gòu)建是二代測序建庫技術(shù)的基礎(chǔ),是非常重要的質(zhì)控點。
文庫構(gòu)建是至關(guān)重要的中間環(huán)節(jié),即上機之前樣本是否準(zhǔn)備妥當(dāng)。主要涉及濃度和片段大小是否符合要求,通常用Qsep 系列全自動核酸片段分析系統(tǒng)做質(zhì)控。
設(shè)備展示
Qsep系列全自動核酸片段分析系統(tǒng)是一款專業(yè)的高通量測序質(zhì)控設(shè)備,可以對提取的gDNA、RNA、打斷樣本、文庫等樣本進行質(zhì)檢,幫助獲取最佳質(zhì)量的文庫用于測序,得到最大最優(yōu)的測序數(shù)據(jù)。
Qsep具有高分辨率、高靈敏度、通量靈活、性價比高和操作簡便等特點。針對gDNA和RNA樣本,Qsep有基因組和Total RNA評分系統(tǒng),即DQN和RQN值,用戶可數(shù)字化評價樣本質(zhì)量。
上圖展示了不同質(zhì)量的gDNA圖譜,軟件根據(jù)樣本質(zhì)量可以自動給出DQN(DNA Quality Number),DNA的質(zhì)量以0-10分作為評價標(biāo)準(zhǔn),根據(jù)完整性數(shù)值,輔助判定樣本是否符合后續(xù)的建庫測序?qū)嶒灥囊蟆?/span>
檢測Total RNA的完整性是提取實驗典型QC步驟。Qsep系列設(shè)備特有的RNA質(zhì)量值(RQN:RNA Quality Number)可對每個RNA樣品的質(zhì)量作出標(biāo)準(zhǔn)化評估。如圖RNA樣本質(zhì)量范圍從相對完整(RQN: 8.9)到降解(RQN: 2.3 )。RQN同RIN?一樣為1-10分評分且評分標(biāo)準(zhǔn)高度相關(guān)。
針對打斷樣本和文庫樣本,Qsep系列設(shè)備可對打斷樣品進行檢測并給出片段分布結(jié)果,及主要分布區(qū)間,判斷打斷結(jié)果。
Qsep系列設(shè)備可以對文庫進行質(zhì)檢,根據(jù)測序讀長需求,制定不同質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn),幫助獲取最佳質(zhì)量的文庫用于測序,得到最大最優(yōu)的測序數(shù)據(jù)。
Qsep系列設(shè)備具有高度自動化的特點,從上樣檢測到毛細管電泳檢測分析,再到檢測結(jié)束后的毛細管通道清洗,均無需任何人工干預(yù),即可得到樣品片段的大小、濃度和相對濃度,并以峰圖或膠圖的形式呈現(xiàn)。
培訓(xùn)內(nèi)容